Sui dati connessi e descritti nel dizionario possono essere liberamente definite, tramite una serie di "Query Engine" o "Rule-Engine", regole di normalizzazione, correlazione, elaborazione e controllo dedicate a modellare ed implementare le necessarie logiche di business. La potenza espressiva delle logiche definibili è elevatissima e non si limita a pochi casi predefiniti.

Grazie ad IrionDQ è possibile vedere l'insieme dei data link definiti per l'accesso di dati esterni come una sorta di "tabelle virtuali" sui cui è possibile definire regole e creare associazioni e normalizzazioni. I Query Engine sono estremamente potenti e possono essere utilizzati anche in un architettura multilivello.

Questi motori possono essere facilmente estesi con l’utilizzo di librerie e/o programmi esterni integrati nel processo (es: Excel® con VBA, librerie per calcoli specifici, librerie ed applicazioni statistiche etc).